怀孕期间当然可以做亲子鉴定，怀孕期间做的亲子鉴定也叫胎儿亲子鉴定、产前亲子鉴定，是指利用基因测序技术鉴定胎儿遗传意义上的父亲。当胎儿遗传意义上的父亲是谁不得而知时，胎儿亲子鉴定可从孕妇静脉血（采取孕妇静脉血为样本的鉴定亦称无创亲子鉴定）中提取胎儿DNA，通过鉴定胎儿的DNA（脱氧核糖核酸）确认父子关系。
 


胎儿亲子鉴定的原理是什么?
胎儿在未出生之前，可以通过DNA测序技术，采集孕妇静脉血，然后从中分离出胎儿游离的DNA片段信息，再把疑父的DNA样本提取出来，双方对比，就可以准确的判断双方之间是否存在亲子关系了。
 
怀孕多久可以做亲子鉴定？
现在在正规亲子鉴定中心受理的无创胎儿亲子鉴定，最早在孕妇怀孕满5周一直到产前都可以做，采用第二代高通量测序技术，鉴定有效位点达13000多个，保证鉴定结果准确率高达99.9999%，跟产后亲子鉴定一致。

胎儿亲子鉴定如何做？
怀孕做胎儿亲子鉴定的方法很简单，只需要孕妇提供10毫升静脉血，男方可以提供的样本有(血液、血痕、口腔棉签、毛发、指甲、牙刷、烟头等任意其一即可。
胎儿亲子鉴定办理流程：
一．咨询预约。咨询鉴定机构工作人员，准确告知孕期，预约好采样办理时间。
二．采集样本。 孕妇可选择现场采集静脉血/预约护士上门采血/自行采血；疑父可以采集血液、血痕、口腔棉签、毛发、指甲、牙刷、烟头等任意其一即可。
三．样本送检。胎儿亲子鉴定不用提供实名或者身份证明，把采集好的检材匿名邮寄到亲子鉴定机构，或者本人携带检材来亲子鉴定机构或者现场采样送检。
四、等待结果。正常办理胎儿亲子鉴定等待5-7个工作日出具结果报告，委托人可以自取或者选择邮寄到指定地址。